El departamento está regado por el río Magdalena (que recorre su territorio de sur a norte hasta desembocar en el Caribe, en Bocas de Ceniza), el canal del Dique, las ciénagas de Luruaco, El Totumo, Playa Grande, Real y Marroquín, y el embalse del Guájaro. La región presenta un clima tropical, con una temperatura media anual de 27 ºC; los alisios son intensos en febrero y marzo y originan aridez en la costa; las precipitaciones son más intensas en el sur, llegando a alcanzar los 1.300 mm anuales. Cuenta con buenas playas arenosas, como las de Santa Verónica, Palmarito, Sabanilla y Puerto Colombia (a 20 km al oeste de la capital).